学院目前开设有农学、畜牧兽医（牧医）、园艺、金融、会计电算化、旅游与酒店管理、机电一体化、电气技术、农业机械化、高等护理、计算机及应用、计算机网络技术、汉语言、体育、表演（舞蹈方向），小学教育、纺织工程等17个全日制高职专业，保留有30多个地方急需的中心、阿克苏地区第六国家职业技能鉴定所、阿克苏地区旅游培训中心、阿克苏地区会计人员继续教育培训单位、阿克苏地区再就业培训定点机构、自治区中等职业学校学生计算机应用能力等级考试考点、上海白玉兰网远程教育点、新疆财经学院阿克苏函授站。
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